醫院醫療機構的類型不同，醫院一體化污水處理設備所排放的污水也應當依據不同的方式進行污水分類處理。醫療廢水處理常用處理工藝必須保證處理出水符合要求，關鍵要選擇三種處理工藝：提升處理實際效果的一級處理、二級處理和簡單生化處理。

醫院醫療一體化污水處理設備的工藝選擇：

1、傳染病醫院一定要選擇二級處理，并且要進行預消毒處理。

2、對于經濟發展不發達地區的中小型綜合性醫院，在處理能力不足時，可選擇簡單的生化處理工藝作為對策，之后逐步完成二級處理或提升一級處理能力。

3、綜合醫院廢水排放至大城市下水管道(中下游設置二級污水處理廠)，建議選擇一級處理工藝，提高處理實際效果時，一體化污水處理設備建議選用一級處理工藝。處理工藝的應用狀況充分考慮到以上標準。

伴隨著污水處理技術的不斷發展，國內廣泛應用一體化污水處理設備的處理工藝有：

1、提升一體化污水處理設備的一級處理實際效果的處理工藝。

2、對于處理出水進入大城市污水處理廠二級處理的綜合性醫院，應提高處理的實效性，提高污泥負荷，降低消毒劑用量。

3、提高一體化污水處理設備一級處理的實際效果宜按兩種方式來完成：對現行一級處理工藝進行更新改造以提升除掉實際效果和選擇一級加強處理技術。

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